交会穴指2条或2条以上经脉相交会之腧穴，共有90个左右。其中有的在体表交会，有的则在体内贯通。主要用于治疗交会经脉所属脏腑的病变。如大椎为诸阳经之交会穴，能通一身之阳；头维是足阳明、足少阳两经交会穴，可同时治疗阳明、少阳两型头痛，即偏正头痛；三阴交为足三阴经交会穴，故能广泛用于治疗属于任脉、足三阴经的病变。下面是在砭术中一些常用的交会穴名称、经脉归属和与之相交的经脉名称。
手太阴经中府穴，交会足太阴经。
手阳明经肩髃穴，交会手少阳经和阳 脉。
手阳明经迎香穴，交会足阳明经。
手太阳经听宫穴，交会手少阳经、足少阳经。
手少阳经角孙穴，交会足少阳经。
足阳明经承泣穴，交会于督脉及阳 脉。
足阳明经地仓穴，交会手阳明经、督脉、阳 脉。
足阳明经头维穴，交会于足少阳经、阳维脉。
足太阳经睛明穴，交会手太阳经、足阳明经、阴 脉和阳 脉。
足太阳经大杼穴，交会手太阳经、足少阳经和督脉。
足太阳经申脉穴，交会阳 脉。
足少阳经头窍阴穴，交会足太阳经。
足少阳经风池穴，交会手少阳经和阳维脉。
足少阳经肩井穴，交会手少阳经、足阳明经和阳维脉。
足少阳经环跳穴，交会足太阳经。
足太阴经大横穴，交会阴维脉。
任脉承浆穴，交会手阳明经、足阳明经和督脉。
任脉膻中穴，交会手太阳、手少阳、足太阴、足少阴四条经脉。
任脉中脘穴，交会手太阳、手少阳、足阳明三条经脉。
督脉的百会穴，交会足太阳经、足少阳经和足厥阴经。
督脉的大椎穴，交会手阳明经、手太阳经、手少阳经、足阳明经、足太阳经、足少阳经，共六条阳经。
督脉的长强穴，交会于足少阴经脉。